Ligesom varer kan blive miljømærket, er det også muligt at miljømærke butikker. For at blive miljømærket er der en lang række krav, der skal overholdes. Coop har deltaget i et projekt fra Miljøstyrelsen, der skulle kortlægge, hvilke barrierer der er for at få miljømærket forskellige butikker. Coop stillede 9 butikker til rådighed for projektet, og konklusionen på projektet er, at der er 3 kriterieområder, der giver særlige udfordringer.

Det er minimering af det affald, der går til forbrænding – her er det særligt organisk affald, der skal sorteres fra. Hvis butikken har for meget usorteret affald, kan den ikke blive miljømærket. Sortimentet – der skal være et bredt sortiment af miljømærkede og økologiske varer, som skal være tydeligt skiltet. Energiforbrug, hvor kravene strammes år for år og hvor kølemøblerne i butikken er afgørende for, hvor meget energi butikken bruger, og dermed kan være udslagsgivende for, om butikken kan miljømærkes eller ej.